細菌性龜頭炎的治療方法主要有保持局部清潔、局部用藥、口服抗生素、中藥坐浴、手術治療等。
1. 保持局部清潔：對於細菌性龜頭炎患者，保持局部清潔十分關鍵。細菌容易在污垢積聚的環境中滋生繁殖，加重炎症。每日用溫水清洗龜頭和包皮，能夠及時清除包皮垢等細菌滋生的溫床，減少細菌數量，緩解炎症症狀。清洗時動作要輕柔，避免損傷龜頭皮膚。同時要勤換內褲，選擇棉質、寬松的內褲，保持局部透氣，不利於細菌生存，從而輔助治療細菌性龜頭炎。
2. 局部用藥：局部用藥可直接作用於患處，有效抑制和殺滅細菌。如莫匹羅星軟膏，它能阻礙細菌細胞壁的合成，達到抗菌效果；復方多粘菌素B軟膏，對多種革蘭氏陽性菌和陰性菌有抗菌活性；克霉唑乳膏，可抑制真菌細胞膜的合成，對合併真菌感染的細菌性龜頭炎有較好療效。使用時需先清潔局部，然後將適量藥膏均勻塗抹在龜頭及包皮內板，遵醫囑用藥，一般每日2 - 3次，能快速減輕炎症。
3. 口服抗生素：當局部炎症較為嚴重時，口服抗生素能從全身層面抑制細菌。常用的有頭孢克肟膠囊，它能抑制細菌細胞壁的合成，起到殺菌作用；左氧氟沙星片，通過抑制細菌DNA旋轉酶的活性，阻礙細菌DNA複製；阿莫西林克拉維酸鉀片，可破壞細菌細胞壁的合成。這些藥物經口服後進入血液循環，到達全身各處，對引起龜頭炎的細菌進行殺滅，遵醫囑按療程服用，能有效控制炎症擴散。
4. 中藥坐浴：中藥坐浴利用中藥的藥理作用，通過溫熱的藥液浸泡，促進局部血液循環，減輕炎症。例如苦參、黃柏、蛇床子等中藥，苦參有清熱燥濕、殺蟲的功效，黃柏能清熱燥濕、解毒療瘡，蛇床子可燥濕祛風、殺蟲止癢。將這些中藥適量加水煎煮後，待溫度適宜時進行坐浴，每次15 - 20分鐘，每日1 - 2次，能起到抗菌消炎、消腫止痛的作用，輔助治療細菌性龜頭炎。
5. 手術治療：對於包皮過長或包莖導致細菌性龜頭炎反復發作者，手術治療是較為有效的方法。因為過長的包皮或包莖容易藏污納垢，為細菌提供生存環境，即使經過藥物治療，也容易復發。通過包皮環切手術，切除過長的包皮，使龜頭能夠充分暴露，減少細菌滋生的空間，從根本上解決了細菌感染的隱患，從而達到治療細菌性龜頭炎的目的。
在治療細菌性龜頭炎期間，患者要注意個人衛生，保持局部清潔乾燥。避免性生活，防止交叉感染。飲食上要清淡，避免食用辛辣、刺激性食物，戒煙戒酒。同時，務必嚴格遵醫囑按時用藥、復診，以便醫生及時瞭解病情變化，調整治療方案，確保疾病能夠徹底治癒。
