肛瘻手術後恢復時間一般在 20 天到 60 天左右。低位單純性肛瘻恢復相對較快，大約 20 天到 30 天；高位複雜性肛瘻恢復較慢，通常需要 40 天到 60 天。
肛瘻手術的恢復時間受多種因素影響。手術創面大小是關鍵因素之一，創面小，愈合所需時間就短；創面大，愈合過程相對漫長。比如低位單純性肛瘻，其瘻管位置低且簡單，手術造成的創面較小，身體修復起來相對容易，所以恢復快。而高位複雜性肛瘻，瘻管位置深且分支多，手術創面大，身體需要更多時間來修復受損組織，恢復時間也就更長。
患者自身的身體狀況也對恢復時間有重要影響。年輕、身體素質好且無基礎疾病的患者，身體的自我修復能力強，術後恢復速度會比較快。相反，年老體弱、患有糖尿病等慢性疾病的患者，身體機能較差，傷口愈合能力弱，恢復時間會明顯延長。術後的護理和飲食也會影響恢復進程。保持傷口清潔、遵循科學飲食的患者，恢復往往更順利。
肛瘻手術後要多休息，避免劇烈運動，防止傷口裂開。保持肛門清潔，按照醫生要求定期換藥，促進傷口愈合。飲食上，多吃富含膳食纖維的食物，保持大便通暢，避免便秘或腹瀉對傷口造成刺激。嚴格遵循醫生的囑咐，按時服藥、復診，以便及時發現並處理恢復過程中出現的問題，確保身體早日康復。
