每天凌晨三四點肚子不舒服可能是腹部著涼、飲食不當、胃腸功能紊亂、腸道寄生蟲感染、腸易激綜合徵等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有保暖、調整飲食、藥物治療等。
1. 腹部著涼：夜間睡眠時若腹部保暖不足，易使胃腸道受寒冷刺激，引發痙攣，導致肚子不舒服。可增添衣物、使用熱水袋熱敷腹部，能有效緩解痙攣，減輕不適。日常睡眠要注意腹部保暖，避免著涼。
2. 飲食不當：睡前大量進食或食用辛辣、油膩、生冷食物，會加重胃腸負擔，引起消化不良，致使凌晨肚子不適。需調整飲食習慣，睡前適量進食，避免刺激性食物。可遵醫囑服用健胃消食片、多酶片、大山楂丸，促進消化。
3. 胃腸功能紊亂：長期精神壓力大、生活不規律等易引發胃腸功能紊亂，出現肚子不舒服症狀。要規律作息、放鬆心情。可遵醫囑口服馬來酸曲美布汀片、雙歧桿菌四聯活菌片、復方谷氨酰胺腸溶膠囊調節胃腸功能。
4. 腸道寄生蟲感染：腸道內有寄生蟲，夜間活動時會刺激腸道，引起不適。注意個人衛生，養成飯前便後洗手的習慣。可遵醫囑服用阿苯達唑片、甲苯咪唑片、左旋咪唑寶塔糖驅蟲。
5. 腸易激綜合徵：這是一種功能性腸道疾病，受多種因素影響，凌晨時症狀可能發作。要避免誘發因素，如某些食物、壓力等。可遵醫囑使用匹維溴銨片、奧替溴銨片、復方枸櫞酸阿爾維林軟膠囊緩解症狀。
日常要保持良好的生活和飲食習慣，規律作息，適度運動，若症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，遵醫囑檢查治療。
